MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1101

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016904	CTT	2	6	81	86	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016904	TG	3	6	818	823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016904	GTC	2	6	2436	2441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016904	GAC	2	6	2490	2495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016904	GCCAG	2	10	2505	2514	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016904	CCA	2	6	2515	2520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016904	TCA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016904	GCAA	2	8	2687	2694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016904	TCGT	2	8	2722	2729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016904	TGA	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016904	TCA	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016904	TAT	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016904	CGG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016904	TGT	2	6	4004	4009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016904	ACC	2	6	4063	4068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016904	TGC	2	6	4122	4127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016904	CCT	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016904	GTT	3	9	4492	4500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016904	ATC	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016904	T	6	6	4539	4544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016904	CA	3	6	4568	4573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016904	ATG	2	6	4623	4628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016904	TCC	2	6	4641	4646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016904	TGTC	2	8	4647	4654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016904	A	7	7	4690	4696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016904	A	7	7	4700	4706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016904	TGGAG	2	10	4757	4766	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016904	TTG	2	6	4858	4863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016904	ATCC	2	8	4887	4894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016904	CCT	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016904	GAT	2	6	5237	5242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016904	GTTGTG	2	12	5246	5257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016904	TG	3	6	6219	6224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016904	CTT	2	6	6333	6338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016904	C	6	6	6378	6383	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_016904	CCT	2	6	6395	6400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016904	CTA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016904	TGT	2	6	6447	6452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016904	ATG	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016904	TTA	2	6	6611	6616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016904	T	6	6	6636	6641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016904	GAT	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016904	ATAC	2	8	7086	7093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016904	TCT	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016904	TTA	2	6	7113	7118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016904	T	6	6	8753	8758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016904	AT	3	6	8783	8788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016904	A	8	8	8834	8841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016904	GT	3	6	9571	9576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016904	AACA	2	8	9634	9641	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016904	TG	3	6	9992	9997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016904	TTC	2	6	10020	10025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016904	CTTTC	2	10	10086	10095	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016904	ATG	2	6	10139	10144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016904	TG	3	6	10230	10235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016904	T	6	6	10295	10300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016904	TGTT	2	8	10336	10343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016904	T	6	6	10342	10347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016904	TAA	2	6	13770	13775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016904	CA	4	8	13783	13790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016904	ATT	2	6	13801	13806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016904	A	6	6	13813	13818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016904	GAG	2	6	14106	14111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016904	CGGG	2	8	15059	15066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016904	CTC	2	6	15106	15111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016904	CGCGG	2	10	15131	15140	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016904	CGG	2	6	15174	15179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016904	ACGGG	2	10	15182	15191	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016904	CAC	2	6	15380	15385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016904	CGC	2	6	16789	16794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016904	GCG	2	6	16801	16806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016904	CGC	2	6	17665	17670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016904	CGC	2	6	17798	17803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016904	CCT	2	6	17819	17824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016904	GGCAC	2	10	17964	17973	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016904	AAC	2	6	17997	18002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016904	GGA	2	6	18003	18008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016904	ACGG	2	8	18444	18451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016904	GGC	2	6	18452	18457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016904	GCC	2	6	18461	18466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016904	GCC	2	6	19117	19122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016904	CG	3	6	19131	19136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016904	GCG	2	6	19186	19191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016904	CCGGC	2	10	19195	19204	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_016904	GGC	2	6	19319	19324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016904	GTC	2	6	19330	19335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016904	GCT	2	6	19356	19361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016904	CCG	2	6	19379	19384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016904	CGC	2	6	19461	19466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016904	GT	3	6	19507	19512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016904	GCA	2	6	19534	19539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016904	GCC	2	6	19552	19557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016904	G	6	6	19592	19597	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016904	AGG	2	6	19777	19782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016904	CTC	2	6	19791	19796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016904	TCAG	2	8	19849	19856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016904	TG	3	6	20423	20428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016904	AAT	2	6	20738	20743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016904	CCGCC	2	10	22716	22725	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
100	NC_016904	GCA	2	6	22738	22743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016904	GGT	2	6	24558	24563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016904	CGG	2	6	25480	25485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016904	GCC	2	6	25502	25507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016904	GCCT	2	8	25529	25536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016904	AGG	2	6	25544	25549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016904	GCG	2	6	25559	25564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016904	TGT	2	6	25616	25621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016904	GGC	2	6	25665	25670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016904	GTC	2	6	25676	25681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016904	GCT	2	6	25702	25707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016904	CCG	2	6	25725	25730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016904	CGC	2	6	25808	25813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016904	GT	3	6	25854	25859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016904	CCG	2	6	25894	25899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016904	CAG	2	6	25963	25968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016904	A	6	6	26017	26022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016904	GTG	2	6	26057	26062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016904	GAA	2	6	26105	26110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016904	CAA	2	6	27588	27593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016904	CAG	2	6	27619	27624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016904	CT	3	6	28100	28105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016904	CCG	2	6	28106	28111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_016904	CTAT	2	8	28147	28154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016904	GGC	2	6	28459	28464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016904	AGG	2	6	28488	28493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016904	A	6	6	29912	29917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016904	TTTAT	2	10	29924	29933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016904	ATAA	2	8	29958	29965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016904	A	6	6	29970	29975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016904	GAA	2	6	29978	29983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016904	T	7	7	29991	29997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016904	GTG	2	6	30043	30048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016904	ACC	2	6	30057	30062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016904	TTG	2	6	30071	30076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016904	CGT	2	6	30080	30085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016904	TTC	2	6	30088	30093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016904	GCG	2	6	30107	30112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016904	GT	3	6	30131	30136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016904	GCC	2	6	30179	30184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_016904	G	6	6	30219	30224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016904	TACA	2	8	30225	30232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016904	GTC	2	6	30251	30256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016904	GA	3	6	30262	30267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016904	GTG	2	6	30342	30347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016904	CTC	2	6	30416	30421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_016904	GAG	2	6	30459	30464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016904	T	8	8	31356	31363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016904	ATC	2	6	31369	31374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016904	ATG	2	6	31388	31393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016904	TC	3	6	31751	31756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016904	ATC	2	6	31781	31786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016904	AACT	2	8	31790	31797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016904	ATG	2	6	31840	31845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016904	ATTT	2	8	39683	39690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016904	GTT	2	6	39737	39742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016904	ATT	2	6	39755	39760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_016904	ACT	2	6	39871	39876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_016904	ATA	2	6	40818	40823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_016904	TTG	2	6	40924	40929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_016904	TAAT	2	8	41801	41808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016904	AATG	2	8	41828	41835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016904	ATT	2	6	41900	41905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_016904	TTG	2	6	41975	41980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_016904	TC	3	6	42893	42898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_016904	AT	3	6	42918	42923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016904	GAA	2	6	50717	50722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_016904	A	7	7	52210	52216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_016904	TATGG	2	10	83241	83250	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_016904	A	6	6	83395	83400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_016904	TGT	2	6	83562	83567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_016904	CT	3	6	103780	103785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.